黃埔軍校的課程，主要是軍事課和政治課。在后期還有一些學習文化、外語和自然科學的課程。

　　軍事課，軍校初創時期主要是根據學制為半年的計劃，在課程設置上首先選定最為急需的基礎科目：學科和術科。學科方面，以步兵操典、射擊教范和野外勤務令等基本軍事常識，繼則教以4大教程：戰術、兵器、交通、筑城。相配套的教材，有講述軍事原理、原則等內容的《戰術學》、《兵器學》、《交通學》、《地形學》、《軍制學》、《筑城學》等課本。同時還有教授如何制定戰略戰術、作戰計劃、動員計劃的課程。術科方面，有制式教練、實彈射擊、馬術、劈刺以及行軍、宿營、戰斗聯絡等，尤以單人戰斗教練為主，繼至班、排、連、營教練。學科與術科均以講授實戰中的應用為主。除課堂講授外，還設有課外“軍事演講”制度，定期講授軍事形勢、戰役經過和先進軍事知識。除教官、顧問擔任演講外，還鼓勵學員請愿演講，以求教學相長，推動軍事學術的研究。

　　軍校南京、成都時期的軍事課，依據學制延長情況，延長了各學期的軍事課時，一些原有的軍事課程在時間上相對“放大”，并根據實戰要求，增加了一些新的軍事課內容。

　　政治課是當時黃埔軍校有別于其他軍校的顯著特點。黃埔軍校的政治課課程在廣州、南京、成都三個時期各有不同，除三民主義等基礎課程之外，多是依據當時的政治形勢而進行教學。廣州時期第1至第5期學員在軍校中所接受的政治課，依照政治教育大綱具體實施。南京、成都時期各期學員由于在校時間不等、學制不同，所受的政治教育內容也不盡相同，政治教育大綱在科目內容上前后也不相一致，后期較詳實于前期。

　　軍校辦校初期，規定的政治課程有8門，詳細科目依次是：帝國主義的解剖、中國民族革命問題、社會發展史、帝國主義侵略史、中國近代民族革命史、各國政黨史略、三民主義、國民黨史。1925年，軍校的政治課多達26門。1926年的政治教育大綱中，科目已多達40余種。后期科目雖然詳細于前期，但內容基本上是大體一致的，是以進行最基本的革命理論和革命知識教育為主要內容。軍校廣州時期的政治教育，在具體實施內容上主要有3個方面：三民主義教育，愛民教育，軍紀軍法教育和養成。南京時期的政治課增加了五權憲法、國內外時事報告，特別是突出增加了反共內容。到成都時期，又加授資本主義政治學、經濟學、本校光榮史等課程。